昆山两岸经济自由贸易试验区明确打造两岸产业合作转型升级的先行先试区、两岸中小企业深度合作的重要载体、两岸交流合作模式创新的示范平台。以及在产业集聚发展、创新平台建设、合作水平提升等方面实现新突破，在商品交易、现代物流、文化创意、科技服务等方面形成新亮点，在中小企业融资服务、科技金融体系建设、两岸货币结算等方面构建新机制的三大全新目标。